Pacienty jsou zejména nemocní s horečnatými onemocněními, infekcemi dýchacích cest a plic, močových cest a ledvin, infekcemi nervového systému (včetně osob přijatých k plánovanému vyšetření mozkomíšního moku získaného lumbální punkcí k potvrzení nebo vyloučení infekční příčiny obtíží), průjmovými onemocněními, virovými hepatitidami, infekcemi kůže, podkoží, měkkých tkání a kostí. Dále jsou na klinice léčeni pacienti s komplikacemi klasických vysoce nakažlivých infekčních onemocnění, jako jsou plané neštovice, spalničky nebo příušnice, a také navrátilci z exotických oblastí, např. s tyfem, malárií a dalšími tropickými horečnatými onemocněními. Pokud si to epidemiologická situace vyžádá, může klinika zabezpečit umístění nemocných i s dalšími nakažlivými nemocemi
Umístění na lůžka Kliniky infekčních nemocí je indikováno zejména pro tyto diagnózy:
- nejasné horečnaté stavy
- lymeská borrelióza II. a III. stadia
- klíšťová encefalitida
- neuroinfekce (aseptická meningitida, encefalitida)
- virové hepatitidy
- HIV
- infekce kostí, včetně spondylodiscitidy
- infekce kloubů, včetně totálních endoprotéz (TEP)
- importované nákazy (horečka dengue, malárie, atd.)
- infekční endokarditida
- infekce trávicího traktu – průjmová infekční onemocnění, klostridiová enterokolitida
- respirační infekce, chřipka
- infekce močových cest
- některé pohlavně přenosné nemoci
- herpetické infekce vyžadující hospitalizaci (těžká varicella, pásový opar)
- parotitida
- exantémová infekční onemocnění
- erysipel, těžká flegmóna a další infekce měkkých tkání
Lůžková část je zařízena tak, aby mohla zajistit bezpečnou péči o pacienty, kteří vylučují vzduchem přenosné choroboplodné zárodky, o pacienty s těžším průběhem nemoci vyžadujícím průběžné kontroly stavu, monitorování životních funkcí a náročnější infuzní léčbu.
Pacienti se závažným průběhem malárie jsou hospitalizováni na Klinice anesteziologie, resuscitace a intenzivní medicíny ÚVN. Infektolog u těchto pacientů řídí antimalarickou léčbu.
