Oddělení grantové

Výzkumná, vývojová a inovační činnost (dále jen VVI) a její rozvoj zůstává jednou z priorit ÚVN – VFN Praha. Tradiční výzkumné zaměření a dlouhodobě realizované výstupy, hodnocené především počtem a kvalitou výsledků, bude zachováno ve dvou základních směrech, a to v oblastech onkologie a infekčních komplikací. Tyto směry výzkumu lze považovat za nosné z pohledu samostatného výzkumu nebo výzkumu vázaného na jiná pracoviště. Zmíněné oblasti jsou v souladu s prioritami výzkumu uvedenými v Národní politice VVI, schválené vládou ČR 27. 4. 2013 s aktualizací v roce 2016, a odpovídají potřebám dlouhodobého rozvoje VVI činnosti ÚVN, tj. rozvoje zejména interních, chirurgických a neurochirurgických oborů s ohledem na priority a potřeby zřizovatele – MO ČR. Třetím základním tématem je trauma - s ohledem na priority ÚVN jako akreditovaného traumacentra a na potřeby MO ČR

Cílem karotické endarterektomie je prevence ischemické cévní mozkové příhody, jedné z nejčastějších příčin trvalého postižení či úmrtí ve vyspělých zemích. Současná indikační doporučení jsou založena dominantně na hodnocení stupně stenózy způsobené aterosklerotickým plátem. Přestože je známo, že charakter plátu může souviset s jeho rizikem klinické symptomatologie, zatím není vyjádřen v současných doporučeních American Heart Association (AHA). Na vývoj a charakter plátu má nejspíše velký význam hemodynamika v karotickém řečišti. Cílem našeho projektu je popsat vztah mezi hemodynamickými parametry a charakterem karotického plátu. Správnost našich matematických kalkulací chceme potvrdit pomocí laboratorních modelů karotických stenóz. Vizí našeho projektu je získat nástroj, který by dokázal včas diferencovat rizikové pláty od těch méně rizikových a poskytl možnost časné intervence před rozvojem klinické symptomatologie a tím zefektivnil význam preventivních opatření, jakým je karotické endarterektomie

Meningiomy baze lební se často projeví neurologickou symptomatikou, která je způsobena kompresí neurovaskulárních struktur. Základním terapeutickým principem je chirurgická resekce. Vztah mezi rozsahem chirurgické resekce, recidivou a celkovou dobou přežití pacientů je dobře dokumentován. Radikální resekce je však v některých případech zatížena poměrně vysokou morbiditou a mortalitou. Dobrá znalost anatomických poměrů, zejména vztahu nádoru k arachnoidálním membránám, by mělo pomoci ke snížení morbidity i mortality chirurgické léčby. Meningiomy během svého růstu způsobují postupnou dislokaci arachnoidálních membrán a okolních struktur. Arachnoidea formuje disekční koridor čím je vrstva pevnější a vícevrstevnatá tím radikálnější může být resekce. Klasifikace meningiomů baze lební zohledňující tento princip umožní snazší volbu vhodného terapeutického přístupu a usnadní plánovaní chirurgického zákroku. Plánovaná retrospektivní a prospektivní multicentrická studie otestuje danou hypotézu a ozřejmí rizikové faktory pro resekci meningiomů baze lební.

Ateroskleróza je celosvětově nejčastější příčinou úmrtí a nejčastější příčinou cévní mozkové příhody. Cílem projektu je vytvořit software pro digitální analýzu ultrazvukového obrazu karotické stenózy, srovnat charakteristiky při vizuální a digitální analýze ultrazvukového obrazu nestabilního (symptomatického) a stabilního (asymptomatického) aterosklerotického plátu, detekovat změny v hladině vybraných plazmatických microRNA u pacientů se stabilním a nestabilním plátem a stanovit charakteristiky nestabilního plátu s ověřením hypotézy, že je možné identifikovat aterosklerotické pláty v karotidě s vyšším rizikem progrese anebo cévní mozkové příhody pomocí digitální analýzy ultrazvukového obrazu a genetické analýzy cirkulující mikroRNA. Identifikace charakteristik nestabilního plátu pomůže zlepšit do budoucna indikační kritéria pro karotickou endarterektomii či stenting u pacientů se stenózou karotidy nebo indikaci potenciální změny medikamentózní terapie. Digitální analýza obrazu by měla umožnit zlepšení diagnostiky nestabilního aterosklerotického plátu se snížením vlivu subjektivní chyby. Genetická analýza cirkulující mikroRNA je nový slibný přístup k hodnocení rizika progrese plátu

Hepatocelulární karcinom (HCC) je nejčastějším primárním tumorem jater, jehož rozvoj je vázán na onemocnění jaterní cirhózou. Jedinou možností zlepšení nepříznivé prognózy HCC je diagnostika v časném stádiu. V současnosti se sledování rizikových skupin opírá o ultrasonografické vyšetření jater, jehož senzitivita a specificita je však nedostatečná. Existuje tak naléhavá potřeba stanovení vysoce spolehlivého biomarkeru. K tomuto účelu lze využít nového přístupu v podobě analýzy krevní plazmy unikátní kombinací vysoce citlivých metod chiroptické a vibrační spektroskopie – elektronového cirkulárního dichroismu, Ramanovy optické aktivity, infračervené a Ramanovy spektroskopie. Primárním cílem je nalézt nové biomarkery, které budou schopny spolehlivě odlišit pacienty s jaterní cirhózou bez HCC od těch s již rozvinutým HCC, případně identifikovat i premaligní léze. V letech 2019–2022 bude do studie zařazeno 100 pacientů s cirhózou bez HCC, 100 s cirhózou a HCC a 50 zdravých jedinců. Pomocí pokročilých spektroskopických metod a metabolomiky bude provedena analýza biomolekul v krevní plazmě.

(1) Porovnat genomické a epigenomické profily nádorových buněk u pacientů s různými podtypy primárních a recidivujících gliomů pomocí integrované cytogenomické analýzy, masivního paralelního sekvenování a metylačně specifických přístupů jako první krok k prozkoumání evolučních vztahů a nádorové heterogenity. (2) Studovat fylogenetické a evoluční vztahy ve vzorcích primárních a recidivujících gliomů pomocí RAD sekvenování (restriction site-associated DNA sequencing). (3) Studovat intratumorální heterogenitu v různých vzorcích odebraných ze stejného nádoru u pacientů s glioblastomem (stupeň IV) pomocí RAD a sc-seq (single cell sequencing) sekvenování.

Cílem navrhovaného projektu je komplexní vyhodnocení vlivu intraprostatických a cirkulujících steroidů a endokrinních disruptorů na stadium karcinomu prostaty (KP) a recidivu nemoci po radikální operaci (robotické radikální prostektomii). Analýza nejméně 30 steroidů a 9 endokrinních disruptorů bude provedena u 150 pacientů s diagnostikovaným KP pomocí nově vyvinuté citlivé metody kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí. Získaná biochemická data budou korelována s klinickými parametry po 3 a 6 měsících od radikální operace. Cíle zahrnují především: 1) Porovnání steroidních hormonů v prostatě a krevní plasmě, se specifickým zaměřením na steroidy zahrnuté v klasické a alternativních drahách k DHT a 11-ketoandrogeny. 2) Stanovení koncentrací endokrinních disruptorů ze skupiny bisfenolů (bisfenol A-BPA, BPS, BPF, BPAF) a parabenů (metyl-, etyl-, propyl-, butyl-, benzyl paraben) v prostatě a v krevní plasmě. 3) Porovnání hladin steroidů v nádorové a nenádorové tkáni (ověřené histopatologicky) u každého pacienta. 4) Vyhodnocení vlivu intraprostatických steroidů na stadium KP a recidivu nemoci. 5) Vyhodnocení vlivu endokrinních disruptorů bisfenolů a skupiny parabenů na patogenezi KP a recidivu nemoci. 6) Vyhodnocení výsledků získaných parametrů pro zpřesnění očekávaného klinického průběhu, prognózy onemocnění, identifikaci rizikových faktorů KP a predikci recidivy nemoci po radikální operaci.

Hlavním cílem projektu je prokázat, že metabolomické vyšetření plasmy a karotického plátu jsou rospěšné při detekci nestabilního karotického plátu. Konkrétní následné cíle projektu jsou: (1) vytvoření hemodynamického fantomu pro testování přesnosti TCD detekce mikroembolizace (MES) a testování TCD přístrojů. 2 / metabolomická analýza arteriosklerotických plátů a plazmy (včetně lipidomické analýzy) symptomatických a asymptomatických pacientů a jejich korelace s detekcí míry mikroembolizace před karotickou endarterektomií. 3 / metabolomická analýza tromboembolů (včetně lipidomické analýzy) kardioembolické etiologie a původu z aterosklerotického postižení velkých cév 4 / vývoj algoritmu pro stanovení rizika nestability karotických aterosklerotických plaků s využitím údajů o metabolomické a lipidomické analýzy, klinických a radiologických údajů. 5 / porovnání metabolomu (včetně lipidomu) tromboembolů u pacienta se symptomatickou karotickou stenózou s metabolomem (včetně lipidomu) příslušných nestabilních karotických plátů. 6 / testování mikrochirurgické embolektomie na bezpečnost a účinnost při léčbě cévní mozkové příhody jako alternativní techniky v případě selhání standardní terapie.

1. Nalézt vztah mezi změnami hemodynamika uvnitř IA a zánětlivými změnami včetně polarizace makrofágů 2. Nalézt vztah mezi hemodynamickými změnami vedoucími k poškození endotelu uvnitř intrakranálních cév 3. Posoudit vliv statinů a extracelulárních vezikul na reparaci/léčbu endotelu.

Cílem této prospektivní studie je identifikovat pacienty s rizikem rekurence kolorektálních lézí a pokusit se s využitím mutačního a klinickopatologického fenotypu navrhnout optimální intervaly dispenzárních kolonoskopií, a to zejména u vysoce rizikové skupiny pacientů. Dílčí cíle jsou: 1. Stanovení mutačního profilu a mutační nálože pomocí zavedené heteroduplexní analýzy založené na PCR a DCE u 200 pacientů na základě vyšetření všech jejich indexových a synchronních lézí nalezených během indexové kolonoskopie. 2. Klinické a histopatologické hodnocení a mutační profilování všech metachronních lézí nalezených během pěti let dispenzarizace. 3. Korelace klinických a histopatologických parametrů s mutačním fenotypem pacienta. 4. Korelace mutačního fenotypu pacienta s výskytem metachronní léze / lézí během dispenzarizace. 5. Porovnání mutačního profilu lézí z indexové kolonoskopie s mutačním profilem metachronní léze/ lézí. 6. Analýza podobnosti mutačního profilu lézí nalezených ve stejných / blízkých oblastech kolorekta.

Identifikovat nové fenotypy či subfenotypy CRS a CRSwNP, s a bez alergií kombinací detailního mapování složení nosního mikrobiomu, objektivní olfactometrie a pomocí imunologických characteristic (profily cytokinů/chemokinů, změny populací imunitních buněk) pro optimalizaci léčebných postupů či sekundární prevenci. Specifické cíle: 1. analýza složení nosního mikrobiomu, 2. objektivní olfaktometrie, 3. detekce profilů sekretovaných cytokinů/chemokinů kultivovaných biopsií 4. změny exprese markerů přirozené imunity, exprese chemokinových a cytokinových receptorů a dalších subpopulací imunitních buněk.

1. Popsat detailně pathoanatomii Maisonneuveovy zlomeniny a změnit tak dosud mylně tradované klasické představy (ruptura interoseální membrány, proximální posun fibuly vzhledem k talu apod.). 2. Popsat detailně pathoanatomii Bosworthovy zlomeniny, upozornit na existenci této entity a jejích základních radiologických znaků. 3. Popsat střednědobé a dlouhodobé výsledky u Maisonneuveovy zlomeniny, střednědobé a dlouhodobé výsledky u Bosworthovy zlomeniny. 4. Vytvořit algoritmus prvotního ošetření, Rtg a CT diagnostiky Maisonneuveovy a Bosworthovy zlomeniny, který by současně upozorňoval na nejčastější chyby a omyly v této fázi ošetření (zavřená repozice, perkutánní technika zavádění suprasyndesmálních šroubů apod.). 5. Navrhnout algoritmus operační léčby včetně operačních přístupů, sekvence ošetření jednotlivých poranění a techniky osteosyntézy.

1. Harmonizovat stávající metodiky pro analýzu metabolomu a proteomu v souladu s požadavky/závěry pracovní skupiny WG3 konsorcia AtheroNET a na základě aktivit v rámci WG3 této akci. 2. Pomocí metabolomiky a lipidomiky popsat děje probíhající při akutním koronárním syndromu, cévní mozkové příhodě a rozdíly mezi nimi. 3. Pomocí proteomiky popsat děje probíhající při akutním koronárním syndromu, cévní mozkové příhodě a rozdíly mezi nimi.